Skupina visokih dužnosnika HDZ-a na čelu s Vladimirom Šeksom još je 2005., upozorila Branimira Glavaša da je istraga o ratnim zločinima daleko odmaknula i da su optužbe svjedoka za ratni zločin u Osijeku vrlo ozbiljne. Tada su mu predložili da se povuče iz politike i počne pripremati svoju obranu. Glavaš je to odbio, osmislio projekt regionalne slavonske stranke i na lokalnim se izborima u svibnju prošle godine u Osijeku našao nasuprot svojoj dojučerašnjoj stranci HDZ-u.
Glavaš je početkom prošle godine upozoren da bi se mogao suočiti s ozbiljnom optužnicom i tada je, prema informacijama iz vrha HDZ-a, vodstvo HDZ-a procjenilo je tada da bi i za samog Glavaša, a i za stranku, bilo najbolje da se on povuče iz politike smatrajući da bi njegov daljnji politički angažman tijekom istrage, a potom i tijekom vjerojatnog sudskog procesa štetio i HDZ-u, ali i njemu samome.
U HDZ-u insinuacijom ocjenjuju Glavaševe optužbe da je u obračunu s njime instrumentaliziran i glavni državni odvjetnik Mladen Bajić. Sugovornik Slobodne Damacije iz vrha HDZ-a podsjeća da je riječ o čovjeku kojega je izabrala bivša vlast i čiji ured istrage u potpunosti provodi autonomno od politike.